مع بداية الحرب بين الجيش السوداني ومليشيا “الدعم السريع”، والتي دخلت في يناير/ كانون الثاني 2025 شهرها الـ22، كان القصر الجمهوري أحد أبرز بؤر الصراع والمعارك داخل العاصمة، وذلك بعد سيطرة المتمردين عليه بداية الأحداث، مع عدد من المواقع الإستراتيجية الأخرى.